इस्लामिक रिसर्च फाऊंडेशननं 2011 साली राजीव गांधी चॅरिटेबल ट्रस्टला 50 लाखांची देणगी दिली होती. त्याच्या एक महिन्यानंतर रुग्णालयाच्या मदतीनं 25 लाख देण्याची योजना होती. जेव्हा एनआयएनं झाकीर नाईकच्या घरावर आणि एनजीओवर छापा मारला होता त्यावेळी देणगीचे हे कागदपत्र त्यांच्या हाती लागले होते.
इस्लामिक रिसर्च फांऊडेशनकडे या देणगीची नोंद आहे. दरम्यान, राजीव गांधी फाऊंडेशनचं म्हणणं आहे की, हे पैसे राजीव गांधी चॅरिटेबल ट्रस्टला देण्यात आले होते. जे काही महिन्यानंतर त्यांना परतही करण्यात आले होते. दुसरीकडे इस्लामिक रिसर्च फाउंडेशनचं म्हणणं आहे की, त्यांनी कोणतीही रक्कम अद्यापपर्यंत परत मिळालेली नाही.
दरम्यान, या संपू्र्ण प्रकरणावरुन भाजप आणि काँग्रेस मध्ये बरेच वाद-प्रतिवाद सुरु आहेत.